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对新冠病毒起源的误读该休矣

王宇歌 博士 Hanson临床科研 2021-01-19

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关键词:新型冠状病毒病;病毒起源;Hanson解读


许多人对PNAS这篇新型冠状病毒ABC“簇”分类,和之前北京大学的L/S亚型研究十分感兴趣,因为觉得这暗示了病毒起源信息。还有一些舆论把这些研究与纽约时报报道的纽约病例来源于欧洲的信息联系起来,混淆为纽约病例起源于欧洲。
新冠病毒演化和迁移简史

我们也收到很多询问,希望提出我们的更清晰解读。为此,Hanson解读专栏科学家王宇歌博士再次撰文,对新冠病毒测序结果及病毒起源研究进行科学解释


曾经说过多次,我们追溯一个病毒起源的科学方法(而不是政治或舆论宣传方法)只有一种,就是通过病毒测序进行遗传进化树分析

对于很多历史上的病毒传染病,比如1918西班牙流感,我们现在之所以能够追溯其起源,是因为2005年美国CDC Julie Gerberding等人从阿拉斯加的患者遗骸中测序出了病毒序列。而牛津大学Philippe Lemey通过测序最早的非洲患者样本中的HIV病毒,将HIV跨种传播追回到了1920年刚果共和国首都金沙萨。

目前关于新型冠状病毒SARS-CoV-2的任何病毒起源研究,其病毒序列都是来源于Genbank和GISAID两个公共数据库,而这两个数据库中第一个病毒序列是第一例被报道的COVID-19病人所感染病毒的序列
这名患者于2019年12月26日于武汉市中心医院就诊2020年1月5日复旦大学张永振等将从这名患者中分离出病毒序列上传至Genbank (MN908947)。这一序列成为了目前所有病毒序列的起源
无论如何进行遗传进化树分析,这个武汉病例序列必然是目前所有病毒来源的起点
这也就是为什么在上述两个研究中,A和S分别是祖先病毒,都最早在武汉发现,而随着时间推移却在武汉很少见。


于是许多人质疑中国科学家为什么要第一时间上传序列。恰恰相反的是,
1,正是因为中国科学家上传了病毒序列,现在当我们面对“没有及早知会国际社会”或“信息不透明”的指责以及面对各种“甩锅”行为的时候,第一时间上传了病毒序列成为了我们官方驳斥他国指责最常用也是最有力的反驳证据
2,上传病毒序列也肯定了我们在控制疫情方面的努力及科技能力
3,更重要的是,因为这一序列的上传,WHO得以根据这一序列开发诊断试剂盒并推广至全世界;中国很多公司也根据这一序列开发试剂盒从而提供诊断。诊断试剂的推广是疫情得以及时控制的重要原因。
4,同时,之后所有重要的研究开发,包括疫苗开发和病毒结构研究都是基于这一病毒序列
5,病毒序列演化使遗传学家、生物信息学家和流行病学家可以追踪病毒的迁移及预测病毒的人群传播方式(比如判断纽约的病毒来自于欧洲;意大利病毒来自于德国),从而得以制定卫生政策甚至颁布旅行禁令
所以应该肯定中国科学家第一时间上传病毒序列的重大意义


编者按:
和国内好朋友交流时坦言,中国需要更多科学家网红。即除了进行科学研究之外,科学家也需要对上通过听证传递科学依据、对下通过各种途径普及科学知识。
自媒体乱象,和国士钟南山(对上)、网红张文宏医生(对下),展示的都是这一需求的迫切性。
可以看到,海外推特上活跃着一大批科学家,他们一直承担着科研之外的社会责任。

时过境迁,从2003年到2010年,两次疫情,可以很清楚地看到中国医生和科学家的跨越式发展。中国医生和科学家在新冠肺炎中表现卓越。
所以我们也有理由期待更多中国科学家/医生的自媒体受到关注,成为网红
而我们,也正在摸索着践行。

学术界没有重现2003年SARS研究的尴尬

医学科学家如何影响美国国家事务的决策?


Shared Destiny. 

Shared Responsibility.


希望朋友们及家人,

都平平安安。


声明:
尽管我们力求表达清晰准确,但受制于编者的认识和理解水平,仍可能存在谬误,非常欢迎和感激大家的指正。
本公众号推文仅为学术交流,不构成对临床诊治的意见。


关于我们:
Hanson解读由在美国工作的医生和医学科学家组成,通过对经典研究论文的解读和专家直接撰写的述评,传递医学进展;在解析SCI论文的同时,推广临床科研设计及论文撰写规范。成员主要包括:王宇歌博士,一直从事病毒新药研发;金冲飞医生,美国执业医师;朱永红博士,从事病毒研究,目前主要做新药研发;谢琰臣博士,从事免疫病临床科研和新药研发。另外,特别感谢美国执业医师Gloria医生的友情支持和我们的编辑部。


编辑:Henry;微信号:healsan。图片来自于网络,版权归原作者所有。


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